Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms