Protein–RNA interactions for Protein: Q76I76

SSH2, Protein phosphatase Slingshot homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH2Q76I76 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms