Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms