Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYTL3Q4VX76 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms