Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI81

KRTAP27-1, Keratin-associated protein 27-1, humanhuman

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP27-1Q3LI81 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP27-1Q3LI81 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP27-1Q3LI81 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP27-1Q3LI81 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP27-1Q3LI81 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP27-1Q3LI81 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP27-1Q3LI81 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP27-1Q3LI81 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP27-1Q3LI81 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP27-1Q3LI81 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP27-1Q3LI81 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP27-1Q3LI81 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP27-1Q3LI81 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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KRTAP27-1Q3LI81 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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KRTAP27-1Q3LI81 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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KRTAP27-1Q3LI81 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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KRTAP27-1Q3LI81 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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KRTAP27-1Q3LI81 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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