Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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SNAPC1Q16533 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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SNAPC1Q16533 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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SNAPC1Q16533 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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SNAPC1Q16533 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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SNAPC1Q16533 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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