Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms