Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
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