Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC27.55■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC27.55■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC27.54■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC27.52■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC27.52■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC27.51■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC27.51■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■■□□ 2
GAPVD1Q14C86 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
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