Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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