Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
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