Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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CHAF1BQ13112 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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