Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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