Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC18■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC18■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC18■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC18■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms