Protein–RNA interactions for Protein: P68366

TUBA4A, Tubulin alpha-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA4AP68366 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA4AP68366 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA4AP68366 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA4AP68366 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA4AP68366 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA4AP68366 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA4AP68366 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA4AP68366 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA4AP68366 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA4AP68366 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA4AP68366 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA4AP68366 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA4AP68366 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA4AP68366 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA4AP68366 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA4AP68366 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA4AP68366 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA4AP68366 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA4AP68366 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA4AP68366 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA4AP68366 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA4AP68366 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA4AP68366 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA4AP68366 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA4AP68366 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA4AP68366 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA4AP68366 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA4AP68366 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA4AP68366 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA4AP68366 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA4AP68366 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA4AP68366 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA4AP68366 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA4AP68366 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA4AP68366 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA4AP68366 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA4AP68366 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA4AP68366 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA4AP68366 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA4AP68366 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA4AP68366 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA4AP68366 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA4AP68366 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA4AP68366 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA4AP68366 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA4AP68366 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA4AP68366 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TUBA4AP68366 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TUBA4AP68366 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA4AP68366 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA4AP68366 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA4AP68366 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA4AP68366 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA4AP68366 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA4AP68366 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA4AP68366 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA4AP68366 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA4AP68366 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA4AP68366 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA4AP68366 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA4AP68366 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA4AP68366 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA4AP68366 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA4AP68366 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA4AP68366 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA4AP68366 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA4AP68366 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA4AP68366 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA4AP68366 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA4AP68366 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA4AP68366 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA4AP68366 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA4AP68366 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA4AP68366 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA4AP68366 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBA4AP68366 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBA4AP68366 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBA4AP68366 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBA4AP68366 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBA4AP68366 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBA4AP68366 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBA4AP68366 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBA4AP68366 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBA4AP68366 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBA4AP68366 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBA4AP68366 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBA4AP68366 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBA4AP68366 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBA4AP68366 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBA4AP68366 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBA4AP68366 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBA4AP68366 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBA4AP68366 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBA4AP68366 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBA4AP68366 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBA4AP68366 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBA4AP68366 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBA4AP68366 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBA4AP68366 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBA4AP68366 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms