Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms