Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms