Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MCCD1P59942 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms