Protein–RNA interactions for Protein: P18505

GABRB1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB1P18505 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms