Protein–RNA interactions for Protein: P13645

KRT10, Keratin, type I cytoskeletal 10, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT10P13645 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRT10P13645 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRT10P13645 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRT10P13645 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRT10P13645 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRT10P13645 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRT10P13645 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRT10P13645 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRT10P13645 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRT10P13645 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT10P13645 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT10P13645 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT10P13645 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT10P13645 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT10P13645 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT10P13645 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT10P13645 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT10P13645 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT10P13645 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT10P13645 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT10P13645 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT10P13645 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT10P13645 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT10P13645 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT10P13645 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT10P13645 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT10P13645 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT10P13645 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT10P13645 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT10P13645 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT10P13645 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT10P13645 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT10P13645 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT10P13645 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT10P13645 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT10P13645 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT10P13645 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT10P13645 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT10P13645 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT10P13645 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT10P13645 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT10P13645 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT10P13645 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT10P13645 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT10P13645 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT10P13645 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT10P13645 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT10P13645 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT10P13645 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT10P13645 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT10P13645 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT10P13645 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT10P13645 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT10P13645 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT10P13645 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT10P13645 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT10P13645 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT10P13645 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT10P13645 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT10P13645 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT10P13645 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT10P13645 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT10P13645 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT10P13645 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT10P13645 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT10P13645 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT10P13645 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT10P13645 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT10P13645 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT10P13645 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT10P13645 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT10P13645 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT10P13645 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT10P13645 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT10P13645 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT10P13645 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT10P13645 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
KRT10P13645 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
KRT10P13645 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRT10P13645 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRT10P13645 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRT10P13645 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRT10P13645 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRT10P13645 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRT10P13645 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRT10P13645 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRT10P13645 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRT10P13645 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRT10P13645 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
KRT10P13645 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
KRT10P13645 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRT10P13645 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRT10P13645 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRT10P13645 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRT10P13645 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRT10P13645 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRT10P13645 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRT10P13645 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRT10P13645 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRT10P13645 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms