Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F6O75461 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F6O75461 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F6O75461 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F6O75461 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F6O75461 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F6O75461 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F6O75461 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F6O75461 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F6O75461 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F6O75461 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F6O75461 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F6O75461 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F6O75461 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F6O75461 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F6O75461 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F6O75461 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F6O75461 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F6O75461 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F6O75461 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F6O75461 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F6O75461 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F6O75461 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F6O75461 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F6O75461 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F6O75461 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F6O75461 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F6O75461 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F6O75461 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F6O75461 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F6O75461 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F6O75461 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F6O75461 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F6O75461 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F6O75461 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F6O75461 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F6O75461 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F6O75461 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F6O75461 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F6O75461 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F6O75461 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F6O75461 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F6O75461 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F6O75461 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F6O75461 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F6O75461 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F6O75461 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F6O75461 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F6O75461 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F6O75461 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F6O75461 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F6O75461 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F6O75461 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F6O75461 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F6O75461 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F6O75461 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F6O75461 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F6O75461 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F6O75461 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F6O75461 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F6O75461 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F6O75461 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F6O75461 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F6O75461 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F6O75461 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F6O75461 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F6O75461 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F6O75461 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F6O75461 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F6O75461 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F6O75461 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F6O75461 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F6O75461 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F6O75461 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F6O75461 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F6O75461 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F6O75461 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F6O75461 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F6O75461 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F6O75461 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F6O75461 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F6O75461 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F6O75461 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F6O75461 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F6O75461 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F6O75461 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F6O75461 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F6O75461 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F6O75461 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F6O75461 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F6O75461 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F6O75461 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F6O75461 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F6O75461 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F6O75461 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F6O75461 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F6O75461 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F6O75461 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F6O75461 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F6O75461 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms