Protein–RNA interactions for Protein: O60547

GMDS, GDP-mannose 4,6 dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDSO60547 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GMDSO60547 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GMDSO60547 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GMDSO60547 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GMDSO60547 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GMDSO60547 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GMDSO60547 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GMDSO60547 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GMDSO60547 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GMDSO60547 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GMDSO60547 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GMDSO60547 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GMDSO60547 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GMDSO60547 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GMDSO60547 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GMDSO60547 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GMDSO60547 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GMDSO60547 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GMDSO60547 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GMDSO60547 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GMDSO60547 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GMDSO60547 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GMDSO60547 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GMDSO60547 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GMDSO60547 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GMDSO60547 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GMDSO60547 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GMDSO60547 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GMDSO60547 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GMDSO60547 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GMDSO60547 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GMDSO60547 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GMDSO60547 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GMDSO60547 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GMDSO60547 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GMDSO60547 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GMDSO60547 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GMDSO60547 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GMDSO60547 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GMDSO60547 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GMDSO60547 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GMDSO60547 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GMDSO60547 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GMDSO60547 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GMDSO60547 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GMDSO60547 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GMDSO60547 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GMDSO60547 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GMDSO60547 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GMDSO60547 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GMDSO60547 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GMDSO60547 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GMDSO60547 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GMDSO60547 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GMDSO60547 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GMDSO60547 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GMDSO60547 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GMDSO60547 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GMDSO60547 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GMDSO60547 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GMDSO60547 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GMDSO60547 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GMDSO60547 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GMDSO60547 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GMDSO60547 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GMDSO60547 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GMDSO60547 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GMDSO60547 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GMDSO60547 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GMDSO60547 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GMDSO60547 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GMDSO60547 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GMDSO60547 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GMDSO60547 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GMDSO60547 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GMDSO60547 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GMDSO60547 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GMDSO60547 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GMDSO60547 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GMDSO60547 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GMDSO60547 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GMDSO60547 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GMDSO60547 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GMDSO60547 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GMDSO60547 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GMDSO60547 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GMDSO60547 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GMDSO60547 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GMDSO60547 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GMDSO60547 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GMDSO60547 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GMDSO60547 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GMDSO60547 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GMDSO60547 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GMDSO60547 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GMDSO60547 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GMDSO60547 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GMDSO60547 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GMDSO60547 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GMDSO60547 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms