Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SGSM2O43147 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms