Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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