Protein–RNA interactions for Protein: U3KPV4

A3GALT2, Alpha-1,3-galactosyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A3GALT2U3KPV4 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms