Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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SNX13Q9Y5W8 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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SNX13Q9Y5W8 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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SNX13Q9Y5W8 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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SNX13Q9Y5W8 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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SNX13Q9Y5W8 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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SNX13Q9Y5W8 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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SNX13Q9Y5W8 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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SNX13Q9Y5W8 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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SNX13Q9Y5W8 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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SNX13Q9Y5W8 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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