Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms