Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV7

MED13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13Q9UHV7 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED13Q9UHV7 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms