Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY4

DNAJB4, DnaJ homolog subfamily B member 4, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB4Q9UDY4 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAJB4Q9UDY4 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNAJB4Q9UDY4 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAJB4Q9UDY4 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAJB4Q9UDY4 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAJB4Q9UDY4 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAJB4Q9UDY4 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAJB4Q9UDY4 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAJB4Q9UDY4 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAJB4Q9UDY4 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAJB4Q9UDY4 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAJB4Q9UDY4 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAJB4Q9UDY4 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAJB4Q9UDY4 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAJB4Q9UDY4 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAJB4Q9UDY4 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAJB4Q9UDY4 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAJB4Q9UDY4 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAJB4Q9UDY4 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAJB4Q9UDY4 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAJB4Q9UDY4 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAJB4Q9UDY4 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAJB4Q9UDY4 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAJB4Q9UDY4 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAJB4Q9UDY4 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAJB4Q9UDY4 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAJB4Q9UDY4 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAJB4Q9UDY4 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAJB4Q9UDY4 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAJB4Q9UDY4 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAJB4Q9UDY4 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAJB4Q9UDY4 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAJB4Q9UDY4 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAJB4Q9UDY4 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAJB4Q9UDY4 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAJB4Q9UDY4 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNAJB4Q9UDY4 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAJB4Q9UDY4 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAJB4Q9UDY4 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAJB4Q9UDY4 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAJB4Q9UDY4 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAJB4Q9UDY4 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAJB4Q9UDY4 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAJB4Q9UDY4 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAJB4Q9UDY4 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAJB4Q9UDY4 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAJB4Q9UDY4 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAJB4Q9UDY4 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAJB4Q9UDY4 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAJB4Q9UDY4 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAJB4Q9UDY4 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAJB4Q9UDY4 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAJB4Q9UDY4 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAJB4Q9UDY4 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAJB4Q9UDY4 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAJB4Q9UDY4 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAJB4Q9UDY4 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAJB4Q9UDY4 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAJB4Q9UDY4 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAJB4Q9UDY4 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAJB4Q9UDY4 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAJB4Q9UDY4 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAJB4Q9UDY4 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAJB4Q9UDY4 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAJB4Q9UDY4 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAJB4Q9UDY4 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAJB4Q9UDY4 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNAJB4Q9UDY4 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAJB4Q9UDY4 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAJB4Q9UDY4 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAJB4Q9UDY4 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAJB4Q9UDY4 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAJB4Q9UDY4 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAJB4Q9UDY4 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAJB4Q9UDY4 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAJB4Q9UDY4 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAJB4Q9UDY4 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAJB4Q9UDY4 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAJB4Q9UDY4 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAJB4Q9UDY4 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAJB4Q9UDY4 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAJB4Q9UDY4 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAJB4Q9UDY4 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAJB4Q9UDY4 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAJB4Q9UDY4 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAJB4Q9UDY4 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAJB4Q9UDY4 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAJB4Q9UDY4 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAJB4Q9UDY4 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAJB4Q9UDY4 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAJB4Q9UDY4 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAJB4Q9UDY4 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAJB4Q9UDY4 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DNAJB4Q9UDY4 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DNAJB4Q9UDY4 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DNAJB4Q9UDY4 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DNAJB4Q9UDY4 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DNAJB4Q9UDY4 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DNAJB4Q9UDY4 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DNAJB4Q9UDY4 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms