Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B2

CFAP74, Cilia- and flagella-associated protein 74, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP74Q9C0B2 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP74Q9C0B2 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP74Q9C0B2 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC25.26■■□□□ 1.64
CFAP74Q9C0B2 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP74Q9C0B2 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms