Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BCO2Q9BYV7 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BCO2Q9BYV7 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BCO2Q9BYV7 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BCO2Q9BYV7 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BCO2Q9BYV7 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BCO2Q9BYV7 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BCO2Q9BYV7 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BCO2Q9BYV7 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BCO2Q9BYV7 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BCO2Q9BYV7 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BCO2Q9BYV7 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
BCO2Q9BYV7 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BCO2Q9BYV7 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BCO2Q9BYV7 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BCO2Q9BYV7 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BCO2Q9BYV7 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BCO2Q9BYV7 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BCO2Q9BYV7 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BCO2Q9BYV7 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BCO2Q9BYV7 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BCO2Q9BYV7 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
BCO2Q9BYV7 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BCO2Q9BYV7 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BCO2Q9BYV7 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BCO2Q9BYV7 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BCO2Q9BYV7 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
BCO2Q9BYV7 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BCO2Q9BYV7 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BCO2Q9BYV7 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BCO2Q9BYV7 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BCO2Q9BYV7 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BCO2Q9BYV7 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BCO2Q9BYV7 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BCO2Q9BYV7 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BCO2Q9BYV7 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BCO2Q9BYV7 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
BCO2Q9BYV7 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BCO2Q9BYV7 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BCO2Q9BYV7 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BCO2Q9BYV7 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BCO2Q9BYV7 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BCO2Q9BYV7 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BCO2Q9BYV7 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BCO2Q9BYV7 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BCO2Q9BYV7 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BCO2Q9BYV7 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BCO2Q9BYV7 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BCO2Q9BYV7 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BCO2Q9BYV7 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BCO2Q9BYV7 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BCO2Q9BYV7 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BCO2Q9BYV7 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BCO2Q9BYV7 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BCO2Q9BYV7 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BCO2Q9BYV7 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
BCO2Q9BYV7 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
BCO2Q9BYV7 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BCO2Q9BYV7 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BCO2Q9BYV7 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BCO2Q9BYV7 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BCO2Q9BYV7 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BCO2Q9BYV7 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BCO2Q9BYV7 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BCO2Q9BYV7 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BCO2Q9BYV7 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BCO2Q9BYV7 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BCO2Q9BYV7 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BCO2Q9BYV7 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BCO2Q9BYV7 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BCO2Q9BYV7 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BCO2Q9BYV7 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BCO2Q9BYV7 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BCO2Q9BYV7 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BCO2Q9BYV7 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BCO2Q9BYV7 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BCO2Q9BYV7 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BCO2Q9BYV7 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BCO2Q9BYV7 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BCO2Q9BYV7 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BCO2Q9BYV7 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BCO2Q9BYV7 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BCO2Q9BYV7 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
BCO2Q9BYV7 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BCO2Q9BYV7 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BCO2Q9BYV7 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BCO2Q9BYV7 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BCO2Q9BYV7 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BCO2Q9BYV7 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BCO2Q9BYV7 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BCO2Q9BYV7 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BCO2Q9BYV7 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BCO2Q9BYV7 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BCO2Q9BYV7 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BCO2Q9BYV7 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BCO2Q9BYV7 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BCO2Q9BYV7 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BCO2Q9BYV7 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BCO2Q9BYV7 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BCO2Q9BYV7 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms