Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms