Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV19

C1orf50, Uncharacterized protein C1orf50, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf50Q9BV19 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C1orf50Q9BV19 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C1orf50Q9BV19 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C1orf50Q9BV19 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C1orf50Q9BV19 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C1orf50Q9BV19 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C1orf50Q9BV19 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C1orf50Q9BV19 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C1orf50Q9BV19 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
C1orf50Q9BV19 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C1orf50Q9BV19 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
C1orf50Q9BV19 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C1orf50Q9BV19 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C1orf50Q9BV19 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C1orf50Q9BV19 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf50Q9BV19 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf50Q9BV19 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf50Q9BV19 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf50Q9BV19 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf50Q9BV19 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf50Q9BV19 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf50Q9BV19 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf50Q9BV19 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf50Q9BV19 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf50Q9BV19 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf50Q9BV19 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf50Q9BV19 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf50Q9BV19 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf50Q9BV19 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf50Q9BV19 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf50Q9BV19 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf50Q9BV19 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf50Q9BV19 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf50Q9BV19 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf50Q9BV19 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf50Q9BV19 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf50Q9BV19 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf50Q9BV19 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf50Q9BV19 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf50Q9BV19 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf50Q9BV19 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf50Q9BV19 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf50Q9BV19 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf50Q9BV19 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf50Q9BV19 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf50Q9BV19 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf50Q9BV19 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf50Q9BV19 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf50Q9BV19 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf50Q9BV19 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf50Q9BV19 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf50Q9BV19 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf50Q9BV19 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf50Q9BV19 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf50Q9BV19 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf50Q9BV19 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf50Q9BV19 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf50Q9BV19 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf50Q9BV19 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf50Q9BV19 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf50Q9BV19 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf50Q9BV19 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf50Q9BV19 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf50Q9BV19 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf50Q9BV19 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf50Q9BV19 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf50Q9BV19 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf50Q9BV19 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf50Q9BV19 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf50Q9BV19 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf50Q9BV19 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf50Q9BV19 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf50Q9BV19 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf50Q9BV19 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf50Q9BV19 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf50Q9BV19 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf50Q9BV19 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf50Q9BV19 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf50Q9BV19 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf50Q9BV19 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf50Q9BV19 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf50Q9BV19 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf50Q9BV19 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf50Q9BV19 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
C1orf50Q9BV19 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
C1orf50Q9BV19 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C1orf50Q9BV19 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C1orf50Q9BV19 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C1orf50Q9BV19 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C1orf50Q9BV19 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C1orf50Q9BV19 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
C1orf50Q9BV19 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C1orf50Q9BV19 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
C1orf50Q9BV19 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms