Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PIK3R4Q99570 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PIK3R4Q99570 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PIK3R4Q99570 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PIK3R4Q99570 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PIK3R4Q99570 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PIK3R4Q99570 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PIK3R4Q99570 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PIK3R4Q99570 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PIK3R4Q99570 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PIK3R4Q99570 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PIK3R4Q99570 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PIK3R4Q99570 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PIK3R4Q99570 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PIK3R4Q99570 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PIK3R4Q99570 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PIK3R4Q99570 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PIK3R4Q99570 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PIK3R4Q99570 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PIK3R4Q99570 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PIK3R4Q99570 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PIK3R4Q99570 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PIK3R4Q99570 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PIK3R4Q99570 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PIK3R4Q99570 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PIK3R4Q99570 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PIK3R4Q99570 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PIK3R4Q99570 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIK3R4Q99570 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIK3R4Q99570 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIK3R4Q99570 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIK3R4Q99570 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIK3R4Q99570 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIK3R4Q99570 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIK3R4Q99570 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIK3R4Q99570 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIK3R4Q99570 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIK3R4Q99570 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIK3R4Q99570 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIK3R4Q99570 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIK3R4Q99570 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIK3R4Q99570 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIK3R4Q99570 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIK3R4Q99570 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIK3R4Q99570 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PIK3R4Q99570 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIK3R4Q99570 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIK3R4Q99570 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIK3R4Q99570 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIK3R4Q99570 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PIK3R4Q99570 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIK3R4Q99570 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIK3R4Q99570 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIK3R4Q99570 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIK3R4Q99570 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PIK3R4Q99570 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIK3R4Q99570 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIK3R4Q99570 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIK3R4Q99570 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIK3R4Q99570 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIK3R4Q99570 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIK3R4Q99570 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIK3R4Q99570 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIK3R4Q99570 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIK3R4Q99570 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIK3R4Q99570 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIK3R4Q99570 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIK3R4Q99570 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIK3R4Q99570 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIK3R4Q99570 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIK3R4Q99570 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PIK3R4Q99570 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PIK3R4Q99570 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIK3R4Q99570 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIK3R4Q99570 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PIK3R4Q99570 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PIK3R4Q99570 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIK3R4Q99570 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIK3R4Q99570 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIK3R4Q99570 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIK3R4Q99570 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIK3R4Q99570 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIK3R4Q99570 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIK3R4Q99570 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PIK3R4Q99570 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIK3R4Q99570 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIK3R4Q99570 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PIK3R4Q99570 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PIK3R4Q99570 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PIK3R4Q99570 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PIK3R4Q99570 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PIK3R4Q99570 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PIK3R4Q99570 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PIK3R4Q99570 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PIK3R4Q99570 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PIK3R4Q99570 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PIK3R4Q99570 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PIK3R4Q99570 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PIK3R4Q99570 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PIK3R4Q99570 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms