Protein–RNA interactions for Protein: Q96RF0

SNX18, Sorting nexin-18, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18Q96RF0 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms