Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms