Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms