Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY1

DNAJA3, DnaJ homolog subfamily A member 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA3Q96EY1 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DNAJA3Q96EY1 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DNAJA3Q96EY1 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DNAJA3Q96EY1 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
DNAJA3Q96EY1 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNAJA3Q96EY1 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNAJA3Q96EY1 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNAJA3Q96EY1 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNAJA3Q96EY1 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNAJA3Q96EY1 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNAJA3Q96EY1 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNAJA3Q96EY1 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNAJA3Q96EY1 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNAJA3Q96EY1 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNAJA3Q96EY1 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNAJA3Q96EY1 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNAJA3Q96EY1 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNAJA3Q96EY1 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNAJA3Q96EY1 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNAJA3Q96EY1 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNAJA3Q96EY1 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNAJA3Q96EY1 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
DNAJA3Q96EY1 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNAJA3Q96EY1 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNAJA3Q96EY1 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNAJA3Q96EY1 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNAJA3Q96EY1 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNAJA3Q96EY1 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNAJA3Q96EY1 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNAJA3Q96EY1 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNAJA3Q96EY1 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
DNAJA3Q96EY1 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNAJA3Q96EY1 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNAJA3Q96EY1 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNAJA3Q96EY1 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNAJA3Q96EY1 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNAJA3Q96EY1 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNAJA3Q96EY1 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNAJA3Q96EY1 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNAJA3Q96EY1 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNAJA3Q96EY1 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNAJA3Q96EY1 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNAJA3Q96EY1 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNAJA3Q96EY1 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNAJA3Q96EY1 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAJA3Q96EY1 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAJA3Q96EY1 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAJA3Q96EY1 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAJA3Q96EY1 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAJA3Q96EY1 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAJA3Q96EY1 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAJA3Q96EY1 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAJA3Q96EY1 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAJA3Q96EY1 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAJA3Q96EY1 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAJA3Q96EY1 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAJA3Q96EY1 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAJA3Q96EY1 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAJA3Q96EY1 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAJA3Q96EY1 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAJA3Q96EY1 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAJA3Q96EY1 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAJA3Q96EY1 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAJA3Q96EY1 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAJA3Q96EY1 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAJA3Q96EY1 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAJA3Q96EY1 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAJA3Q96EY1 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAJA3Q96EY1 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAJA3Q96EY1 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAJA3Q96EY1 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAJA3Q96EY1 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAJA3Q96EY1 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAJA3Q96EY1 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAJA3Q96EY1 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAJA3Q96EY1 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAJA3Q96EY1 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAJA3Q96EY1 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAJA3Q96EY1 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAJA3Q96EY1 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAJA3Q96EY1 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAJA3Q96EY1 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAJA3Q96EY1 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAJA3Q96EY1 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAJA3Q96EY1 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAJA3Q96EY1 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAJA3Q96EY1 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAJA3Q96EY1 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAJA3Q96EY1 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAJA3Q96EY1 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAJA3Q96EY1 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAJA3Q96EY1 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAJA3Q96EY1 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAJA3Q96EY1 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAJA3Q96EY1 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAJA3Q96EY1 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAJA3Q96EY1 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DNAJA3Q96EY1 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DNAJA3Q96EY1 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DNAJA3Q96EY1 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms