Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms