Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCL9

APCDD1L, Protein APCDD1-like, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCDD1LQ8NCL9 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms