Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC00299Q6ZSB3 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC00299Q6ZSB3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC00299Q6ZSB3 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC00299Q6ZSB3 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC00299Q6ZSB3 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC00299Q6ZSB3 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC00299Q6ZSB3 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC00299Q6ZSB3 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC00299Q6ZSB3 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC00299Q6ZSB3 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC00299Q6ZSB3 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC00299Q6ZSB3 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC00299Q6ZSB3 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC00299Q6ZSB3 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC00299Q6ZSB3 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC00299Q6ZSB3 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC00299Q6ZSB3 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC00299Q6ZSB3 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC00299Q6ZSB3 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC00299Q6ZSB3 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LINC00299Q6ZSB3 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LINC00299Q6ZSB3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LINC00299Q6ZSB3 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LINC00299Q6ZSB3 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LINC00299Q6ZSB3 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LINC00299Q6ZSB3 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LINC00299Q6ZSB3 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LINC00299Q6ZSB3 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LINC00299Q6ZSB3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LINC00299Q6ZSB3 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LINC00299Q6ZSB3 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LINC00299Q6ZSB3 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LINC00299Q6ZSB3 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LINC00299Q6ZSB3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LINC00299Q6ZSB3 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LINC00299Q6ZSB3 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LINC00299Q6ZSB3 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LINC00299Q6ZSB3 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LINC00299Q6ZSB3 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
LINC00299Q6ZSB3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LINC00299Q6ZSB3 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LINC00299Q6ZSB3 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
LINC00299Q6ZSB3 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
LINC00299Q6ZSB3 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LINC00299Q6ZSB3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LINC00299Q6ZSB3 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LINC00299Q6ZSB3 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LINC00299Q6ZSB3 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LINC00299Q6ZSB3 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LINC00299Q6ZSB3 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
LINC00299Q6ZSB3 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LINC00299Q6ZSB3 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LINC00299Q6ZSB3 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LINC00299Q6ZSB3 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms