Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms