Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms