Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF239Q16600 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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