Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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