Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms