Protein–RNA interactions for Protein: Q13522

PPP1R1A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1A, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R1AQ13522 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PPP1R1AQ13522 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PPP1R1AQ13522 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PPP1R1AQ13522 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PPP1R1AQ13522 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PPP1R1AQ13522 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PPP1R1AQ13522 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PPP1R1AQ13522 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PPP1R1AQ13522 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PPP1R1AQ13522 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
PPP1R1AQ13522 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PPP1R1AQ13522 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PPP1R1AQ13522 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PPP1R1AQ13522 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PPP1R1AQ13522 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PPP1R1AQ13522 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PPP1R1AQ13522 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
PPP1R1AQ13522 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PPP1R1AQ13522 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PPP1R1AQ13522 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PPP1R1AQ13522 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PPP1R1AQ13522 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PPP1R1AQ13522 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PPP1R1AQ13522 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PPP1R1AQ13522 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PPP1R1AQ13522 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PPP1R1AQ13522 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PPP1R1AQ13522 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
PPP1R1AQ13522 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PPP1R1AQ13522 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PPP1R1AQ13522 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
PPP1R1AQ13522 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PPP1R1AQ13522 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PPP1R1AQ13522 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PPP1R1AQ13522 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PPP1R1AQ13522 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PPP1R1AQ13522 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PPP1R1AQ13522 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PPP1R1AQ13522 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PPP1R1AQ13522 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PPP1R1AQ13522 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PPP1R1AQ13522 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
PPP1R1AQ13522 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PPP1R1AQ13522 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PPP1R1AQ13522 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
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PPP1R1AQ13522 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PPP1R1AQ13522 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PPP1R1AQ13522 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PPP1R1AQ13522 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PPP1R1AQ13522 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PPP1R1AQ13522 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PPP1R1AQ13522 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PPP1R1AQ13522 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PPP1R1AQ13522 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PPP1R1AQ13522 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
PPP1R1AQ13522 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PPP1R1AQ13522 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PPP1R1AQ13522 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PPP1R1AQ13522 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PPP1R1AQ13522 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PPP1R1AQ13522 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PPP1R1AQ13522 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PPP1R1AQ13522 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PPP1R1AQ13522 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PPP1R1AQ13522 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PPP1R1AQ13522 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PPP1R1AQ13522 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PPP1R1AQ13522 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PPP1R1AQ13522 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PPP1R1AQ13522 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PPP1R1AQ13522 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PPP1R1AQ13522 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PPP1R1AQ13522 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
PPP1R1AQ13522 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PPP1R1AQ13522 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PPP1R1AQ13522 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PPP1R1AQ13522 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PPP1R1AQ13522 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PPP1R1AQ13522 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PPP1R1AQ13522 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PPP1R1AQ13522 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PPP1R1AQ13522 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PPP1R1AQ13522 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PPP1R1AQ13522 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PPP1R1AQ13522 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PPP1R1AQ13522 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PPP1R1AQ13522 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PPP1R1AQ13522 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PPP1R1AQ13522 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PPP1R1AQ13522 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PPP1R1AQ13522 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PPP1R1AQ13522 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PPP1R1AQ13522 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PPP1R1AQ13522 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PPP1R1AQ13522 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PPP1R1AQ13522 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PPP1R1AQ13522 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PPP1R1AQ13522 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PPP1R1AQ13522 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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