Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

Predictions only

Length 1,914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RLFQ13129 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RLFQ13129 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RLFQ13129 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RLFQ13129 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RLFQ13129 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RLFQ13129 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RLFQ13129 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RLFQ13129 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RLFQ13129 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RLFQ13129 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RLFQ13129 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RLFQ13129 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RLFQ13129 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RLFQ13129 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RLFQ13129 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RLFQ13129 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RLFQ13129 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RLFQ13129 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RLFQ13129 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RLFQ13129 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RLFQ13129 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RLFQ13129 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RLFQ13129 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RLFQ13129 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RLFQ13129 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RLFQ13129 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RLFQ13129 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RLFQ13129 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RLFQ13129 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RLFQ13129 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RLFQ13129 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RLFQ13129 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
RLFQ13129 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RLFQ13129 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RLFQ13129 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RLFQ13129 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
RLFQ13129 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
RLFQ13129 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RLFQ13129 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RLFQ13129 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
RLFQ13129 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RLFQ13129 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RLFQ13129 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
RLFQ13129 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RLFQ13129 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RLFQ13129 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RLFQ13129 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RLFQ13129 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RLFQ13129 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RLFQ13129 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RLFQ13129 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RLFQ13129 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RLFQ13129 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RLFQ13129 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RLFQ13129 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RLFQ13129 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RLFQ13129 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RLFQ13129 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RLFQ13129 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RLFQ13129 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RLFQ13129 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RLFQ13129 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RLFQ13129 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RLFQ13129 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
RLFQ13129 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
RLFQ13129 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RLFQ13129 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
RLFQ13129 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RLFQ13129 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RLFQ13129 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
RLFQ13129 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RLFQ13129 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RLFQ13129 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RLFQ13129 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RLFQ13129 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RLFQ13129 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RLFQ13129 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RLFQ13129 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RLFQ13129 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RLFQ13129 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RLFQ13129 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RLFQ13129 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RLFQ13129 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RLFQ13129 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RLFQ13129 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RLFQ13129 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RLFQ13129 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RLFQ13129 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RLFQ13129 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RLFQ13129 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RLFQ13129 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
RLFQ13129 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RLFQ13129 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RLFQ13129 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RLFQ13129 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RLFQ13129 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RLFQ13129 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RLFQ13129 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RLFQ13129 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
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