Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms