Protein–RNA interactions for Protein: Q09472

EP300, Histone acetyltransferase p300, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP300Q09472 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EP300Q09472 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EP300Q09472 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EP300Q09472 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EP300Q09472 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EP300Q09472 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EP300Q09472 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EP300Q09472 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EP300Q09472 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EP300Q09472 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EP300Q09472 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EP300Q09472 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EP300Q09472 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EP300Q09472 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EP300Q09472 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EP300Q09472 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EP300Q09472 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EP300Q09472 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EP300Q09472 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
EP300Q09472 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EP300Q09472 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EP300Q09472 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EP300Q09472 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EP300Q09472 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EP300Q09472 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EP300Q09472 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EP300Q09472 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EP300Q09472 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EP300Q09472 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EP300Q09472 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EP300Q09472 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EP300Q09472 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EP300Q09472 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EP300Q09472 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EP300Q09472 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EP300Q09472 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EP300Q09472 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EP300Q09472 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EP300Q09472 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EP300Q09472 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EP300Q09472 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EP300Q09472 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EP300Q09472 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EP300Q09472 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EP300Q09472 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EP300Q09472 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EP300Q09472 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EP300Q09472 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EP300Q09472 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EP300Q09472 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EP300Q09472 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EP300Q09472 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EP300Q09472 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EP300Q09472 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EP300Q09472 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EP300Q09472 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EP300Q09472 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EP300Q09472 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EP300Q09472 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EP300Q09472 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EP300Q09472 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EP300Q09472 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EP300Q09472 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EP300Q09472 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EP300Q09472 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EP300Q09472 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EP300Q09472 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EP300Q09472 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EP300Q09472 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EP300Q09472 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EP300Q09472 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EP300Q09472 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EP300Q09472 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EP300Q09472 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EP300Q09472 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EP300Q09472 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EP300Q09472 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EP300Q09472 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EP300Q09472 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EP300Q09472 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EP300Q09472 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EP300Q09472 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EP300Q09472 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EP300Q09472 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EP300Q09472 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EP300Q09472 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EP300Q09472 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EP300Q09472 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EP300Q09472 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EP300Q09472 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EP300Q09472 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EP300Q09472 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EP300Q09472 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EP300Q09472 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EP300Q09472 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EP300Q09472 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EP300Q09472 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EP300Q09472 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EP300Q09472 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EP300Q09472 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms